ศูนย์การศึกษาพิเศษ ประจำจังหวัดศรีสะเกษ มีการบริหารจัดการสถานศึกษาโดยมีการแบ่งโครงสร้างการบริหารงาน 4 กลุ่มงานคือ 1) กลุ่มบริหารงานวิชาการ 2) กลุ่มบริหารงานทั่วไป 3) กลุ่มบริหารงานบุคคล และ 4) กลุ่มบริหารแผนงานและงบประมาณ ซึ่งทุกกลุ่มงานนำระบบประกันคุณภาพภายในมาใช้การบริหารจัดการงานอย่างเป็นระบบโดยใช้ “ SIKET MODEL” และขับเคลื่อนด้วยวงจรคุณภาพ PDCA ดังนี้
- S : Standard Setting มีการกำหนดเป้าหมายมาตรฐานคุณภาพ จากการวิเคราะห์จุดเน้น บริบท
ความต้องการของสถานศึกษา นโยบายและจุดเน้นจากหน่วยงานต้นสังกัด มาตรฐานการศึกษาระดับต่าง ๆ และจากผลการประเมินคุณภาพภายในและภายนอกที่ผ่านมมา มากำหนดเป็นวิสัยทัศน์ ที่จะนำไปสู่การจัดทำแผนพัฒนาคุณภาพการศึกษ และแผนปฏิบัติการประจำปี
- I : Implementation การขับเคลื่อนคุณภาพสู่มาตรฐาน มีการออกแบบระบบการทำแผนงานโครงการหรือกิจกรรมรองรับมาตรฐานการศึกษาของสถานศึกษาโดยการมีส่วนร่วมของผู้มีส่วนได้ส่วนเสีย
- K : Key Performance การประเมินความสำเร็จตามมาตรฐาน มีการนิเทศ ติดตาม และตรวจสอบการดำเนินงานในหลายระดับ โดยยึดหลักการกระจายอำนาจและการมีส่วนร่วมของผู้บริหาร หัวหน้ากลุ่มงาน และหัวหน้างาน พร้อมทั้งมีการประเมินและจัดทำรายงานผลการดำเนินงานอย่างต่อเนื่อง
- E : Evolution การนำกระบวนการเปลี่ยนแปลงสู่สถานศึกษาเพื่อส่งเสริมการสร้างคุณค่า มีการดำเนินงานระบบประกันคุณภาพภายในที่มีประสิทธิผล ส่งผลให้เกิดการพัฒนาผู้เรียนอย่างเป็นรูปธรรม รวมถึงการพัฒนาด้านกระบวนการบริหารและการจัดการที่ชัดเจน นอกจากนี้ยังส่งเสริมคุณภาพของกระบวนการจัดการเรียนการสอนที่เน้นผู้เรียนเป็นสำคัญอย่างหลากหลาย
- T : Total Quality Culture (TQC) เกิดวัฒนธรรมคุณภาพเพื่อการพัฒนาที่ยั่งยืน โดยยึดหลักระบบประกันคุณภาพการศึกษา ครูและบุคลากรพัฒนาตนเองและคุณภาพการจัดการศึกษา มีการประเมินและรายงานผลรายบุคคลอย่างต่อเนื่อง และนำผลมาปรับปรุง พัฒนาต่อไป